20 Alat Sumber Terbuka dapat Membantu Penelitian Penyembuhan COVID-19

Pemerintah, ilmuwan, dan lembaga penelitian menggunakan teknologi dan inovasi untuk mengatasi COVID-19.

Alat open source telah dikembangkan, dan beberapa terus diuji untuk mendukung upaya yang telah dikerahkan untuk meminimalkan dampak dari virus mematikan ini.

Serangkaian alat sumber terbuka sudah ada, membantu peneliti mempelajari penyakit, mengidentifikasi penyebaran, mencegah penyebaran, dan meminimalkan penyebaran dan kematian lebih lanjut. Berbagai proyek tersedia di Ekosistem Pendidikan yang menguraikan cara menggunakan alat yang berbeda.

Artikel ini membahas beberapa alat dan pustaka sumber terbuka yang digunakan dalam pemantauan, pencegahan dan penahanan, diagnosis, dan pengobatan COVID-19.

Peta Pelacakan COVID-19

Pada bulan Januari, Pusat Sains dan Teknik Sistem JHU meluncurkan a Peta Pelacakan Global COVID-19 yang dengan cepat menjadi sumber tepercaya internasional untuk data pandemi yang berkembang secara real-time.

Peta ini open source dan telah digunakan untuk mendorong penelitian dan upaya visualisasi oleh organisasi media terkemuka, organisasi kecil, dan pemerintah daerah.

DXY-COVID-19-Perayap

DXY-COVID-19-Crawler adalah salah satu proyek sumber terbuka paling awal yang dikembangkan untuk merespons COVID-19 pada bulan Januari.

Pengembang menggunakan data dari DXY.cn, sebuah situs yang digunakan oleh praktisi medis Tiongkok untuk melaporkan dan melacak kasus. Mereka mengembangkan perayap web yang mengumpulkan data dari situs dan membuatnya tersedia melalui API dan gudang data. Kode tersedia di Github.

Buka Paket Data

Kit Data Terbuka (ODK) bukanlah alat baru. Ini telah digunakan sebelumnya selama wabah Ebola di Afrika Barat pada tahun 2004 dan wabah yang lebih baru di Republik Demokratik Kongo pada tahun 2019.

Ini terutama membantu pengguna mengumpulkan, mengelola, dan menggunakan data dalam pelacakan kontak, pemetaan strategis, dukungan keputusan, kepekaan komunitas, dan manajemen kasus.

Komunitas ODK semakin meningkatkan penggunaannya dalam menanggapi COVID-19 dengan menyediakan formulir pelaporan dalam penerapannya. Formulir ini dirancang sesuai dengan protokol Organisasi Kesehatan Dunia untuk menyelidiki kasus dan pelacakan kontak serta penyelidikan.

Pengembang utama juga menawarkan dukungan gratis untuk organisasi mana pun yang telah menerapkan ODK sebagai tanggapan terhadap COVID-19.

  Cara Membuat Akun di Walmart

Nextstrain

Nextstrain melacak evolusi patogen. Ini sebelumnya telah digunakan untuk mengetahui riwayat penyakit keluarga, sehingga memungkinkan prediksi perkembangan penyakit.

Ini telah berhasil digunakan dalam epidemi sebelumnya, seperti Ebola. Melalui data genetik dari Global Initiative on Sharing All Influenza Data (Gisaid), Nextxtrain digunakan untuk mengatasi COVID-19.

DHIS2

Anda mungkin sudah tahu DHIS2. Ini adalah Sistem Manajemen Informasi Kesehatan terbesar di dunia. Ini digunakan di lebih dari 70 negara. Sebagai bagian dari respons terhadap COVID-19, DHIS2 telah merilis paket data digital yang mempercepat deteksi infeksi, pelaporan, pengawasan, dan pengobatan penyakit tersebut.

Paket data digital DHIS2 memanfaatkan metadata standar yang selaras dengan protokol WHO tentang definisi dan pengawasan kasus COVID-19 untuk memungkinkan penerapan dan respons yang cepat.

Pikobar Jawa Barat

Pusat Informasi dan Koordinasi Penyakit dan Bencana Indonesia adalah pusat tanggap krisis yang dibentuk untuk memitigasi dan merespons COVID-19 di provinsi Jawa Barat Indonesia.

Jabar Digital Service, sebagai bagian dari respon, telah mengembangkan sebuah alat dan aplikasi web sumber terbuka yang memungkinkan pengguna mengakses data COVID-19 terbaru.

OpenMRS

OpenMRS adalah sistem perawatan pasien yang digunakan di banyak negara berkembang di seluruh dunia. Karena fleksibilitas dari sistem OpenMRSnegara-negara yang sumber daya kesehatannya terbatas dapat menggunakannya untuk pengawasan, penyaringan, dan pengobatan COVID-19.

Sistem ini dapat membantu mereka memperluas kapasitas mereka dengan memberi mereka akses ke informasi berbasis ilmiah untuk menghadapi krisis.

OpenLMIS

Itu proyek OpenLMIS memanfaatkan taktik yang berfokus pada komunitas untuk mengembangkan sumber terbuka dan sistem informasi manajemen logistik yang dapat disesuaikan. Sistem OpenLMIS berupaya meningkatkan akurasi data, meningkatkan akuntabilitas, meningkatkan ketepatan waktu data, dan visibilitas.

Sistem OpenLMIS berupaya untuk meningkatkan rantai pasokan kesehatan, inventarisasi sumber daya medis untuk memberikan gambaran yang jelas tentang pasokan medis yang tersedia, termasuk alat tes, dan APD (alat pelindung diri). Alat ini dapat digunakan secara efektif untuk mendukung pembuat keputusan dalam mengalokasikan sumber daya sebagai respons terhadap COVID-19.

Situs kesehatan

Itu Proyek Pemetaan Situs Kesehatan Global adalah proyek yang bertujuan untuk memetakan setiap fasilitas kesehatan di dunia dan membuat rincian setiap rumah sakit dapat diakses dengan mudah. Data fasilitas kesehatan telah dapat diakses melalui API.

  Perbaiki Reddit Chat Error Memuat Konten

Dengan berkolaborasi dengan pengguna, tim healthsites.io menangkap dan memvalidasi lokasi dan detail kontak dari setiap fasilitas kesehatan dan membuat data tersedia secara bebas dan dapat diakses melalui Lisensi Data Terbuka.

SORMAS

SORMAS (Sistem Manajemen dan Analisis Respon Wabah Surveilans) adalah sistem e-kesehatan seluler sumber terbuka. Ini telah dikerahkan untuk menerapkan pengendalian penyakit serta prosedur manajemen wabah.

Ini telah digunakan secara efektif di beberapa negara, termasuk Ghana, Nigeria, Nepal, dan Fiji, untuk pengawasan dan deteksi dini COVID-19.

SORMAS adalah sistem sumber terbuka gratis yang mengikuti standar perlindungan data.

COVID-19 Tokyo

Tidak seperti banyak kota dan pemerintahan lainnya, Pemerintah Metropolitan Tokyo telah mengembangkan situs web sumber terbuka yang memberi tahu penduduknya tentang COVID-19. Dengan menjadikannya open-source, situs ini telah mendapatkan kontribusi dari lebih dari 200 pengguna. Tiga kota lainnya, Chiba, Nagano, dan Fukuoka, telah membuat ulang situs web tersebut.

OpenELIS

Tujuan dari sistem kesehatan OpenELIS adalah untuk meningkatkan layanan kesehatan dengan menyediakan sistem manajemen informasi laboratorium berbasis standar yang progresif yang dapat digunakan oleh berbagai inisiatif kesehatan untuk meningkatkan pilihan pengobatan.

Wabah COVID-19 telah menghadirkan tantangan global dalam pelacakan kontak dan pengujian massal terhadap kasus yang dicurigai. Sistem OpenELIS dapat diterapkan secara efektif dalam menanggulangi COVID-19 untuk memfasilitasi pelacakan tes dan hasil laboratorium.

Itu Perangkat Kesehatan Masyarakat adalah kumpulan alat sumber terbuka serta sumber daya akses terbuka yang menargetkan untuk membangun dan menyebarkan alat digital untuk digunakan dalam inisiatif kesehatan masyarakat di daerah yang sulit dijangkau.

Komunitas pengembang Alat Kesehatan Masyarakat telah bergerak untuk mengembangkan alat dan sumber daya yang bertujuan mendukung petugas kesehatan masyarakat untuk mengatasi COVID-19.

BERBUNYI

Itu Model Dampak Rumah Sakit COVID-19 untuk Epidemi (CHIME) adalah aplikasi sumber terbuka yang dikembangkan oleh ilmuwan data di Penn Medicine – University of Pennsylvania. Ini adalah alat online yang memungkinkan rumah sakit memprediksi dampak virus pada sumber daya layanan kesehatan.

Ini dikembangkan menggunakan Python dan ketergantungan sumber terbuka panda.

  Cara Otomatis Beralih Ke Tema Gelap Di Malam Hari Di Firefox

Peta Peduli COVID

Itu Peta Peduli COVID membantu dalam memetakan sumber daya perawatan kesehatan yang sudah ada dan dalam memperkirakan kesenjangan di tempat tidur rumah sakit, ventilator, pasokan medis, dan kepegawaian. Semua metode, alat pengolah data, visualisasi, dan kode sumber gratis dan bersumber terbuka.

Proyek Peta Peduli COVID berupaya mengantisipasi dan bertindak untuk mengumpulkan dukungan guna merawat jumlah infeksi COVID-19 yang berkembang pesat secara efektif dan mereka yang membutuhkan perawatan intensif.

Lokal.ai

Locale.ai telah mengembangkan visualisasi interaktif sumber terbuka dari semua kasus COVID-19 yang dikonfirmasi di seluruh dunia. Ini menanyakan kumpulan data sumber terbuka dari Universitas John Hopkins.

Locale.ai mengembangkan Situs web visualisasi COVID-19 dengan menggunakan Vue.js, yang merupakan kerangka kerja populer yang memungkinkan pengembang membuat aplikasi web modern.

COVID-19 di seluruh dunia

Aplikasi ini memanfaatkan visualisasi peta untuk memantau penyebaran COVID-19, kasus terkonfirmasi, dan perkembangan penyakit di seluruh dunia. Itu menggunakan data dari John Hopkins CSSE.

Pelacak virus corona

Ini adalah aplikasi Shiny yang dikembangkan oleh John Coene. Ini melacak penyebaran COVID-19 dengan menggunakan data dari John Hopkins, data DXY, dan Weixin. Aplikasi ini menunjukkan jumlah kasus yang dicurigai, dikonfirmasi, dan dipulihkan berdasarkan waktu dan wilayah. Kode tersedia di Github.

Kasus Global COVID-19

Kasus Global COVID-19 adalah aplikasi Shiny yang dikembangkan oleh Christoph Schoenenberger yang menunjukkan perkembangan COVID-19 pada peta, plot, tabel ringkasan, dan gambar. Kodenya tersedia di Github.

Pemerintah dan COVID-19

Ini adalah aplikasi Shiny yang dikembangkan oleh Sebastian Engel-Wolf. Ini memetakan pertumbuhan eksponensial COVID-19, hari untuk menggandakan infeksi, kasus terkonfirmasi, angka kematian, dan jumlah kasus terkonfirmasi per 100.000 orang di berbagai wilayah. Kode tersedia di Github.

Membungkus

Komunitas open-source telah merespons pandemi COVID-19 dengan cepat dan efektif. Banyak proyek telah dibangun dan terus dibangun untuk menanggulangi penyebaran penyakit tersebut. Artikel ini menjelaskan beberapa proyek. Masih ada ketidakpastian tentang bagaimana penyakit ini akan berkembang dalam beberapa minggu mendatang. Lebih banyak proyek yang dapat memanfaatkan teknologi sumber terbuka yang ada akan menemukan tempat dalam perang melawan penyakit mematikan ini.

Jaga keselamatan!

Artikel oleh Dr. Michael J. Garbade, CEO, Education Ecosystem